Sono passati 2 anni dalla sconfitta di Sin. Il culto di Yevon si è disfatto e poco a poco la vita su Spira sta ritornando alla tranquillità e alla normalità di sempre. Yuna ha intrapreso un viaggio insieme a Rikku e Paine, la nuova ragazza. E' in cerca di Tidus, dopo aver visto una sfera che lo riguardava. Kimahri è diventato il Capo Tribù dei Ronso anche se non è molto amato dal suo popolo per la storia del corno spezzato. Non lo credono un Capo coraggioso e deciso. Cosa non vera, perchè si dimostrerà molto saggio.
Wakka e Lulu invece sono insieme da parecchio e aspettano pure un figlio.
Yuna riuscirà a trovare Tidus? Questo dipende da voi.